Es un convento de frailes franciscanos.

En la zona de Basurto, desde 1432, existía una ermita dedicada a San Mamés, y en 1446 el papa Eugenio IV autorizó la fundación del convento. Desde el siglo XV hasta el siglo XIX, fue el hogar de los frailes de la Orden de San Francisco y albergó un colegio, concretamente una escuela de gramática.

En el siglo XIX, el ayuntamiento de Bilbao adquirió este convento para que albergase la Casa de la Misericordia. Ésta se encontraba en Atxuri y necesitaba de un mayor espacio. El resto de los terrenos están ocupados por campo de fútbol de San Mamés, viviendas y el espacio musical de la Sociedad Coral de Bilbao.